Découverte de nouveaux prédicteurs génomiques de rechute dans la leucémie aiguë lymphoblastique à cellules B de l’enfant – Ma Clinique – 13 août 2024
Des scientifiques du St. Jude Children’s Research Hospital, du Seattle Children’s et du Children’s Oncology Group (COG) ont identifié de nouvelles variations génétiques qui influencent le risque de rechute chez les enfants atteints de leucémie aiguë lymphoblastique à cellules B à risque standard (LAL-B-SR), le cancer infantile le plus courant. L’identification de prédicteurs génomiques de rechute dans la LAL-B-SR fournit une base pour un meilleur diagnostic, une personnalisation précise de l’intensité du traitement et potentiellement le développement de nouvelles approches thérapeutiques. L’étude a été publiée aujourd’hui dans le Journal d’oncologie clinique.
La LAL à risque standard a un excellent pronostic, avec des taux de rémission supérieurs à 90 %. Cependant, environ 15 % des patients qui parviennent à une rémission subissent ultérieurement une rechute. Les études précédentes examinant les altérations génomiques pour prédire le risque de rechute se sont principalement concentrées sur les sous-groupes de LAL à haut risque. La LAL-B-SR représente un groupe plus large de patients et représente environ la moitié des enfants atteints de LAL qui rechutent. Cette étude est l’une des premières à examiner systématiquement à grande échelle les facteurs génétiques qui influencent le risque de rechute dans la LAL-B-SR.
La LAL, le cancer infantile le plus fréquent, est une belle réussite avec plus de 90 % des enfants guéris. Mais il reste une population d’enfants dont la maladie n’est pas complètement guérie, et nous n’avons pas encore complètement compris pourquoi il en est ainsi. Cette étude s’est concentrée sur ce groupe de cas mal compris, pour lesquels nous en savons moins sur les caractéristiques qui influencent le risque d’échec du traitement et de récidive de la maladie.
Charles Mullighan, MBBS (Hons), MSc, MD, directeur adjoint du St. Jude Comprehensive Cancer Center et membre du département de pathologie, co-auteur principal
Identifier les variations génétiques qui modulent le risque
Le profilage génomique permet d’identifier les altérations génétiques spécifiques associées à la susceptibilité au cancer, au risque de rechute et à la façon dont les tumeurs réagissent aux traitements. Ces études permettent aux scientifiques et aux cliniciens de prédire la façon dont les patients sont susceptibles de réagir au traitement, fournissant ainsi des informations qui façonnent le traitement de la LAL chez l’enfant. Les résultats de cette étude collaborative démontrent l’importance du profilage génomique pour déterminer avec précision le risque des patients atteints de LAL-B, en conjonction avec les critères traditionnels.
« Nous prévoyons de réduire à l’avenir les thérapies conventionnelles pour les enfants atteints de LAL, car nous savons que de nombreux patients peuvent être guéris avec moins de thérapie », a expliqué le Dr Mignon Loh, co-auteur principal, directeur du Seattle Children’s Cancer and Blood Disorders Center, président émérite du comité COG ALL, directeur du Seattle Children’s Ben Towne Center for Childhood Cancer Research et chef de la division d’hématologie pédiatrique, d’oncologie, de greffe de moelle osseuse et de thérapie cellulaire de Seattle Children’s. « Nous voulons nous assurer d’identifier précisément ces enfants, et grâce à la conception spéciale de l’étude, ce projet nous a permis de le faire. »
Les scientifiques ont effectué un séquençage du génome et du transcriptome sur des échantillons de LAL-B SR ayant rechuté et sur des échantillons restés en rémission complète dans un rapport de un: deux. Ils ont découvert que les sous-types de LAL, les altérations génétiques et les schémas d’aneuploïdie (chromosomes supplémentaires ou manquants) étaient associés au risque de rechute et au délai de rechute. Certains sous-types de LAL-B, tels que l’hyperdiploïde et ETV6::RUNX1 ALL, avait une faible fréquence de rechute, mais d’autres, y compris PAX5-modifié, TCF3/4::HLF, ETV6::RUNX1-like et Similaire à BCR::ABL1 Les patients présentant un risque accru de rechute étaient associés à un risque accru de rechute. Il convient de noter que le type spécifique de modifications génétiques au sein de ces sous-types de LAL-B a également influencé le risque de rechute. Ces travaux ont démontré que les variations génétiques et les sous-types de cancer influencent le risque de rechute dans la LAL-B SR, et que les patients classés comme à risque standard peuvent avoir des tumeurs présentant des caractéristiques à haut risque.
« Le séquençage du génome entier était important pour identifier ces changements de manière précise et complète, et ils n’auraient pas pu tous être identifiés sans lui », a expliqué Mullighan. « Les enfants atteints de LAL SR doivent faire séquencer leur génome de cellules tumorales dès leur diagnostic initial pour identifier si leurs cellules tumorales présentent ces caractéristiques à haut risque, afin que l’intensité de leur traitement initial puisse être augmentée. »
« Au-delà des thérapies conventionnelles, ces informations pourraient également être utilisées pour développer et explorer de nouvelles stratégies de traitement personnalisées », a ajouté Loh.
Auteurs et financement
Les co-premiers auteurs de l’étude sont Ti-Cheng Chang et Wenan Chen de St. Jude.
Les autres auteurs de l’étude sont Mary Shago, Université de Toronto; Karen Rabin, Baylor College of Medicine; Elizabeth Raetz, William Carroll, Perlmutter Cancer Center; Anne Angiolillo, Children’s National Medical Center; Michael Borowitz, Université Johns Hopkins; Michael Burke, Medical College of Wisconsin; Andrew Carroll, Université d’Alabama à Birmingham; I-Ming Chen, Richard Harvey; Université du Nouveau-Mexique, Albuquerque; Nyla Heerema, Université d’État de l’Ohio; Jeremy Wang, Université de Caroline du Nord à Chapel Hill; Eric Larsen, Maine Children’s Cancer Program; Leonard Mattano, HARP Pharma Consulting; Kelly Maloney, Université du Colorado; Nilsa Ramirez, Nationwide Children’s Hospital et Université d’État de l’Ohio; Wanda Salzer, Uniformed Services University; Cheryl Willman, Mayo Clinic; Naomi Winick, University of Texas Southwestern Medical Center; Brent Wood, Université de Californie du Sud; Stephen Hunger, Children’s Hospital of Philadelphia et Université de Pennsylvanie; et Chunxu Qu, Zhongshan Chen, Dale Hedges, Abdelrahman Elsayed, Stanley Pounds, Meenakshi Devidas, Cheng Cheng, Pradyuamma Baviskar, Ilaria Iacobucci, Sima Jeha, Ching-Hon Pui et Gang Wu, St. Jude.
L’étude a été soutenue par les National Institutes of Health (R35 CA197695 et CA21765), le Cancer Moonshot (HHSN261201500003I) et ALSAC, l’organisation de sensibilisation à la collecte de fonds de St. Jude.